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#$Date: 2008-02-08 10:23:56 +0000 (Fri, 08 Feb 2008) $
#$Revision: 101 $
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data_2203603
loop_
_publ_author_name
'Sakai, Ken'
'Yokoyama, Yoshimi'
Hama,Hideki
'Kato, Kaoru'
'Ikuta, Yoshie'
'Tsubomura, Taro'
'Tanase, Tomoaki'
_publ_section_title
;
Bis[\m-3-(N'-methyl-4,4'-bipyridinium-1-yl)propionamidato]bis[cis-
diammineplatinum(II)] hexaperchlorate dihydrate in a head-to-tail
isomerism
;
_journal_issue                   5
_journal_name_full               'Acta Crystallographica, Section E'
_journal_page_first              m664
_journal_page_last               m667
_journal_volume                  60
_journal_year                    2004
_chemical_formula_iupac          '[Pt2 (C14 H16 N3 O)2 (N H3)4] (Cl O4)6, 2H2 O'
_chemical_formula_moiety         'C28 H44 N10 O2 Pt2 6+, 6Cl O4 -, 2H2 O'
_chemical_formula_sum            'C28 H48 Cl6 N10 O28 Pt2'
_chemical_formula_weight         1575.64
_chemical_name_systematic
;
Bis[\m-3-(N'-methyl-4,4'-bipyridinium-1-yl)propionamidato]bis[cis-
diammineplatinum(II)] hexaperchlorate dihydrate
;
_symmetry_cell_setting           Triclinic
_symmetry_space_group_name_Hall  '-P 1'
_symmetry_space_group_name_H-M   'P -1'
_atom_sites_solution_hydrogens   geom
_atom_sites_solution_primary     direct
_atom_sites_solution_secondary   difmap
_cell_angle_alpha                78.116(2)
_cell_angle_beta                 79.305(2)
_cell_angle_gamma                74.210(2)
_cell_formula_units_Z            2
_cell_length_a                   10.0927(5)
_cell_length_b                   11.0827(5)
_cell_length_c                   24.4798(10)
_cell_measurement_reflns_used    2521
_cell_measurement_temperature    296(2)
_cell_measurement_theta_max      27.53
_cell_measurement_theta_min      1.94
_cell_volume                     2553.9(2)
_computing_cell_refinement       'SAINT (Bruker, 2001)'
_computing_data_collection       'SMART (Bruker, 2001)'
_computing_data_reduction        SAINT
_computing_molecular_graphics    'KENX (Sakai, 2002)'
_computing_publication_material
;
SHELXL97, TEXSAN (Molecular Structure Corporation, 2001),
KENX and ORTEPII (Johnson, 1976)
;
_computing_structure_refinement  'SHELXL97 (Sheldrick, 1997)'
_computing_structure_solution    'SHELXS97 (Sheldrick, 1997)'
_diffrn_ambient_temperature      296(2)
_diffrn_detector_area_resol_mean 8.366
_diffrn_measured_fraction_theta_full 0.996
_diffrn_measured_fraction_theta_max 0.996
_diffrn_measurement_device       'Bruker SMART APEX CCD-detector'
_diffrn_measurement_method       \w
_diffrn_radiation_monochromator  graphite
_diffrn_radiation_source         'fine-focus sealed tube'
_diffrn_radiation_type           MoK\a
_diffrn_radiation_wavelength     0.71073
_diffrn_reflns_av_R_equivalents  0.1216
_diffrn_reflns_av_sigmaI/netI    0.3690
_diffrn_reflns_limit_h_max       13
_diffrn_reflns_limit_h_min       -12
_diffrn_reflns_limit_k_max       14
_diffrn_reflns_limit_k_min       -13
_diffrn_reflns_limit_l_max       31
_diffrn_reflns_limit_l_min       -25
_diffrn_reflns_number            24579
_diffrn_reflns_theta_full        27.53
_diffrn_reflns_theta_max         27.53
_diffrn_reflns_theta_min         1.94
_diffrn_standards_decay_%        'variation: 0.005%'
_diffrn_standards_interval_time  330
_diffrn_standards_number         68
_exptl_absorpt_coefficient_mu    5.883
_exptl_absorpt_correction_T_max  0.831
_exptl_absorpt_correction_T_min  0.666
_exptl_absorpt_correction_type   multi-scan
_exptl_absorpt_process_details   '(SADABS; Sheldrick, 1996)'
_exptl_crystal_colour            yellow
_exptl_crystal_density_diffrn    2.049
_exptl_crystal_density_meas      'not measured'
_exptl_crystal_density_method    'not measured'
_exptl_crystal_description       plate
_exptl_crystal_F_000             1536
_exptl_crystal_size_max          0.12
_exptl_crystal_size_mid          0.04
_exptl_crystal_size_min          0.03
_refine_diff_density_max         0.822
_refine_diff_density_min         -0.815
_refine_ls_extinction_expression not_defined
_refine_ls_extinction_method     none
_refine_ls_goodness_of_fit_ref   0.791
_refine_ls_hydrogen_treatment    constr
_refine_ls_matrix_type           full
_refine_ls_number_parameters     633
_refine_ls_number_reflns         11715
_refine_ls_number_restraints     152
_refine_ls_restrained_S_all      0.796
_refine_ls_R_factor_all          0.2556
_refine_ls_R_factor_gt           0.0603
_refine_ls_shift/su_max          0.000
_refine_ls_shift/su_mean         0.000
_refine_ls_structure_factor_coef Fsqd
_refine_ls_weighting_details
'calc w = 1/[\s^2^(Fo^2^)+(0.0288P)^2^] where P = (Fo^2^+2Fc^2^)/3'
_refine_ls_weighting_scheme      calc
_refine_ls_wR_factor_gt          0.0878
_refine_ls_wR_factor_ref         0.1206
_reflns_number_gt                3519
_reflns_number_total             11715
_reflns_threshold_expression     I>2\s(I)
_[local]_cod_data_source_file    hb6032.cif
loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
'x, y, z'
'-x, -y, -z'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_description
_atom_type_scat_dispersion_real
_atom_type_scat_dispersion_imag
_atom_type_scat_source
H H 0.0000 0.0000 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
C C 0.0033 0.0016 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
N N 0.0061 0.0033 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
O O 0.0106 0.0060 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
Cl Cl 0.1484 0.1585 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
Pt Pt -1.7033 8.3905 'International Tables Vol C Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.4'
loop_
_atom_site_label
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_calc_flag
_atom_site_refinement_flags
_atom_site_occupancy
_atom_site_disorder_assembly
_atom_site_disorder_group
_atom_site_type_symbol
Pt1 0.17071(5) -0.00076(5) 0.32735(2) 0.0548(2) Uani d . 1 . . Pt
Pt2 0.12271(5) 0.27953(5) 0.27841(2) 0.0557(2) Uani d . 1 A . Pt
Cl1 0.1867(6) 0.0117(5) 0.1215(2) 0.1016(15) Uani d . 1 . . Cl
Cl2 0.2885(5) 0.4758(5) 0.0850(2) 0.147(2) Uani d D 1 . . Cl
Cl3 0.7120(4) 0.1117(4) 0.29720(17) 0.0838(13) Uani d D 1 . . Cl
Cl4 0.7444(4) 0.1820(3) 0.48300(15) 0.0724(12) Uani d D 1 . . Cl
Cl5 0.9514(4) 0.3870(3) 0.61476(16) 0.0794(12) Uani d D 1 . . Cl
Cl6 0.2484(5) 0.4149(5) 0.7962(2) 0.1027(17) Uani d . 1 . . Cl
O1 0.2184(9) 0.2736(8) 0.3437(4) 0.072(3) Uani d . 1 A 1 O
O2 0.3342(8) -0.0020(8) 0.2641(4) 0.056(3) Uani d . 1 A . O
O3 0.2476(15) -0.0967(13) 0.1575(5) 0.184(7) Uani d . 1 . . O
O4 0.1812(17) -0.0171(13) 0.0716(5) 0.181(6) Uani d . 1 . . O
O5 0.2505(16) 0.1097(16) 0.1143(7) 0.203(8) Uani d . 1 . . O
O6 0.0519(14) 0.0598(13) 0.1490(6) 0.175(6) Uani d . 1 . . O
O7A 0.377(4) 0.488(4) 0.0357(15) 0.197(5) Uiso d PD 0.331(19) . . O
O7B 0.294(3) 0.4518(19) 0.0289(8) 0.197(5) Uiso d PD 0.669(19) . . O
O8A 0.243(5) 0.611(3) 0.1016(16) 0.197(5) Uiso d PD 0.331(19) . . O
O8B 0.343(3) 0.5791(19) 0.0817(10) 0.197(5) Uiso d PD 0.669(19) . . O
O9A 0.343(4) 0.399(3) 0.1307(14) 0.197(5) Uiso d PD 0.331(19) . . O
O9B 0.390(2) 0.3628(19) 0.1101(9) 0.197(5) Uiso d PD 0.669(19) . . O
O10A 0.159(3) 0.458(4) 0.077(2) 0.197(5) Uiso d PD 0.331(19) . . O
O10B 0.1639(19) 0.476(2) 0.1158(11) 0.197(5) Uiso d PD 0.669(19) . . O
O11A 0.5698(14) 0.1446(15) 0.3034(7) 0.132(3) Uiso d PD 0.685(9) . . O
O11B 0.590(2) 0.192(3) 0.2839(13) 0.132(3) Uiso d PD 0.315(9) . . O
O12A 0.7782(15) 0.1265(16) 0.2416(6) 0.132(3) Uiso d PD 0.685(9) . . O
O12B 0.756(3) 0.011(3) 0.2630(13) 0.132(3) Uiso d PD 0.315(9) . . O
O13A 0.7609(16) 0.1837(14) 0.3284(7) 0.132(3) Uiso d PD 0.685(9) . . O
O13B 0.822(3) 0.177(3) 0.2860(14) 0.132(3) Uiso d PD 0.315(9) . . O
O14A 0.7547(16) -0.0182(12) 0.3212(7) 0.132(3) Uiso d PD 0.685(9) . . O
O14B 0.707(3) 0.050(3) 0.3546(10) 0.132(3) Uiso d PD 0.315(9) . . O
O15A 0.7569(15) 0.0531(11) 0.4845(5) 0.104(3) Uiso d PD 0.702(8) . . O
O15B 0.650(3) 0.104(3) 0.4821(12) 0.104(3) Uiso d PD 0.298(8) . . O
O16A 0.6143(12) 0.2540(12) 0.4631(5) 0.104(3) Uiso d PD 0.702(8) . . O
O16B 0.770(3) 0.253(2) 0.4272(9) 0.104(3) Uiso d PD 0.298(8) . . O
O17A 0.7344(14) 0.2053(13) 0.5389(5) 0.104(3) Uiso d PD 0.702(8) . . O
O17B 0.693(3) 0.261(2) 0.5239(10) 0.104(3) Uiso d PD 0.298(8) . . O
O18A 0.8530(13) 0.2230(12) 0.4464(6) 0.104(3) Uiso d PD 0.702(8) . . O
O18B 0.877(2) 0.093(2) 0.4956(11) 0.104(3) Uiso d PD 0.298(8) . . O
O19A 0.8179(15) 0.4245(16) 0.6003(7) 0.111(3) Uiso d PD 0.636(18) . . O
O19B 0.807(2) 0.446(3) 0.6202(13) 0.111(3) Uiso d PD 0.364(18) . . O
O20A 1.0273(17) 0.2662(14) 0.6004(8) 0.111(3) Uiso d PD 0.636(18) . . O
O20B 0.978(3) 0.300(2) 0.5729(11) 0.111(3) Uiso d PD 0.364(18) . . O
O21A 1.0309(18) 0.4753(15) 0.6008(8) 0.111(3) Uiso d PD 0.636(18) . . O
O21B 1.016(3) 0.492(2) 0.5790(11) 0.111(3) Uiso d PD 0.364(18) . . O
O22A 0.928(2) 0.3604(14) 0.6795(6) 0.111(3) Uiso d PD 0.636(18) . . O
O22B 1.008(3) 0.336(2) 0.6596(11) 0.111(3) Uiso d PD 0.364(18) . . O
O23 0.3715(13) 0.3526(10) 0.8193(5) 0.132(5) Uani d . 1 . . O
O24 0.2280(15) 0.3462(14) 0.7582(6) 0.167(6) Uani d . 1 . . O
O25 0.1368(11) 0.4313(10) 0.8412(5) 0.132(5) Uani d . 1 . . O
O26 0.2637(11) 0.5377(12) 0.7675(5) 0.142(5) Uani d . 1 . . O
O27 0.938(6) 0.285(4) 0.7928(18) 0.38(3) Uani d P 0.50 . . O
O28 0.4819(16) 0.7850(19) -0.0012(10) 0.319(12) Uani d . 1 . . O
N1 0.2636(10) 0.0625(10) 0.3776(4) 0.060(3) Uani d . 1 A 1 N
H1 0.3067 0.0046 0.4019 0.072 Uiso calc R 1 A 1 H
N2 0.6701(18) -0.0866(15) 0.1396(7) 0.125(6) Uani d . 1 . . N
N3 1.1836(17) -0.3304(14) -0.0674(6) 0.091(5) Uani d . 1 . . N
N4 0.3009(10) 0.2094(10) 0.2327(4) 0.058(3) Uani d . 1 . . N
H4A 0.3401 0.2645 0.2105 0.070 Uiso calc R 1 A . H
N5 0.2887(10) 0.2827(11) 0.5138(5) 0.054(3) Uani d . 1 A . N
N6 0.5871(12) 0.4442(13) 0.7163(5) 0.064(3) Uani d . 1 . . N
N7 0.0295(10) 0.2975(9) 0.2105(4) 0.080(4) Uani d . 1 . . N
H7A 0.0288 0.2209 0.2048 0.120 Uiso calc R 1 A . H
H7B 0.0758 0.3358 0.1804 0.120 Uiso calc R 1 . . H
H7C -0.0575 0.3438 0.2161 0.120 Uiso calc R 1 . . H
N8 -0.0596(9) 0.3624(9) 0.3244(4) 0.070(4) Uani d . 1 . . N
H8A -0.0456 0.4230 0.3399 0.105 Uiso calc R 1 A . H
H8B -0.0875 0.3037 0.3514 0.105 Uiso calc R 1 . . H
H8C -0.1245 0.3962 0.3018 0.105 Uiso calc R 1 . . H
N9 0.0763(10) -0.0723(9) 0.2790(4) 0.076(4) Uani d . 1 A . N
H9A 0.0632 -0.1476 0.2967 0.113 Uiso calc R 1 . . H
H9B 0.1299 -0.0813 0.2461 0.113 Uiso calc R 1 . . H
H9C -0.0054 -0.0192 0.2731 0.113 Uiso calc R 1 . . H
N10 0.0178(10) -0.0195(9) 0.3924(4) 0.078(4) Uani d . 1 A . N
H10A 0.0424 -0.0945 0.4142 0.117 Uiso calc R 1 . . H
H10B -0.0601 -0.0145 0.3791 0.117 Uiso calc R 1 . . H
H10C 0.0039 0.0424 0.4125 0.117 Uiso calc R 1 . . H
C1 0.3633(12) 0.0961(16) 0.2320(5) 0.053(4) Uani d . 1 A . C
C2 0.4967(14) 0.0732(12) 0.1854(6) 0.082(5) Uani d . 1 . . C
H2A 0.4709 0.1064 0.1480 0.098 Uiso calc R 1 A . H
H2B 0.5646 0.1151 0.1912 0.098 Uiso calc R 1 . . H
C3 0.5529(15) -0.0618(15) 0.1918(6) 0.112(7) Uani d . 1 A . C
H3A 0.4808 -0.1048 0.1919 0.135 Uiso calc R 1 . . H
H3B 0.5920 -0.0931 0.2268 0.135 Uiso calc R 1 . . H
C4 0.804(2) -0.1011(18) 0.1449(7) 0.123(7) Uani d . 1 . . C
H4 0.8278 -0.0826 0.1765 0.148 Uiso calc R 1 . . H
C5 0.9032(15) -0.1439(15) 0.1023(7) 0.090(5) Uani d . 1 . . C
H5 0.9965 -0.1563 0.1056 0.108 Uiso calc R 1 . . H
C6 0.8686(17) -0.1686(14) 0.0551(6) 0.073(5) Uani d . 1 . . C
C7 0.7304(18) -0.1459(15) 0.0492(6) 0.100(6) Uani d . 1 . . C
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C28 H28A . 0.9600 ?
C28 H28B . 0.9600 ?
C28 H28C . 0.9600 ?
loop_
_geom_contact_atom_site_label_1
_geom_contact_atom_site_label_2
_geom_contact_distance
_geom_contact_site_symmetry_2
_geom_contact_publ_flag
O8B O28 3.17(3) . yes
O22A O27 2.74(4) . yes
O22B O27 3.17(5) . yes
O27 O3 3.10(6) 2_656 yes
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O28 O7A 3.19(5) 2_665 yes
loop_
_geom_angle_atom_site_label_1
_geom_angle_atom_site_label_2
_geom_angle_atom_site_label_3
_geom_angle
_geom_angle_publ_flag
N1 Pt1 N10 88.3(4) yes
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N1 Pt1 Pt2 78.2(3) ?
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N9 Pt1 Pt2 104.3(3) ?
O2 Pt1 Pt2 78.9(2) ?
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N4 Pt2 Pt1 79.0(3) ?
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C15 O1 Pt2 128.1(9) ?
C1 O2 Pt1 125.4(7) ?
C15 N1 Pt1 129.9(9) ?
C4 N2 C8 121.3(16) ?
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C1 N4 Pt2 128.4(9) ?
C18 N5 C22 121.4(13) ?
C18 N5 C17 119.9(12) ?
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C13 C9 C10 117.7(14) ?
C13 C9 C6 122.7(16) ?
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C24 C23 C27 117.4(14) ?
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C26 C27 C23 119.1(14) ?
C15 N1 H1 115.0 ?
Pt1 N1 H1 115.0 ?
C1 N4 H4A 115.8 ?
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Pt2 N7 H7A 109.5 ?
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H10B N10 H10C 109.5 ?
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C2 C3 H3A 110.4 ?
N2 C3 H3A 110.4 ?
C2 C3 H3B 110.4 ?
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H3A C3 H3B 108.6 ?
N2 C4 H4 120.9 ?
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C6 C5 H5 119.3 ?
C4 C5 H5 119.3 ?
C8 C7 H7 121.1 ?
C6 C7 H7 121.1 ?
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C9 C10 H10 121.1 ?
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C10 C11 H11 118.7 ?
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N3 C14 H14A 109.5 ?
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C17 C16 H16A 109.8 ?
C15 C16 H16A 109.8 ?
C17 C16 H16B 109.8 ?
C15 C16 H16B 109.8 ?
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C20 C21 H21 119.4 ?
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N6 C25 H25 118.9 ?
C24 C25 H25 118.9 ?
C27 C26 H26 117.7 ?
N6 C26 H26 117.7 ?
C26 C27 H27 120.4 ?
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N6 C28 H28A 109.5 ?
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loop_
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_geom_torsion
_geom_torsion_publ_flag
O2 Pt1 Pt2 N4 -3.8(4) yes
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N4 C1 C2 C3 179.8(13) ?
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C1 C2 C3 N2 171.0(12) ?
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C4 N2 C8 C7 3(3) ?
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C7 C6 C9 C10 151.7(15) ?
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C6 C9 C10 C11 178.2(13) ?
C12 N3 C11 C10 2(3) ?
C14 N3 C11 C10 -177.5(14) ?
C9 C10 C11 N3 -3(2) ?
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C17 N5 C18 C19 -179.0(11) ?
N5 C18 C19 C20 0.5(19) ?
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C18 N5 C22 C21 2.9(19) ?
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C20 C21 C22 N5 -4(2) ?
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C27 C23 C24 C25 2(2) ?
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C26 N6 C25 C24 -2(2) ?
C28 N6 C25 C24 -177.6(13) ?
C23 C24 C25 N6 0(2) ?
C25 N6 C26 C27 2(2) ?
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N6 C26 C27 C23 -1(2) ?
C24 C23 C27 C26 -2(2) ?
C20 C23 C27 C26 -176.9(13) ?
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
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N7 H7C O13B 1_455 0.89 2.64 2.94(3) 101 yes
N8 H8C O26 2_566 0.89 2.28 3.159(15) 170 yes
N8 H8A O21A 2_666 0.89 2.06 2.92(2) 161 yes
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N8 H8B O16B 1_455 0.89 2.20 3.01(2) 150 yes
N8 H8B O18A 1_455 0.89 2.34 3.155(15) 152 yes
N9 H9A O22A 2_656 0.89 2.29 3.155(18) 164 yes
N9 H9C O13B 1_455 0.89 2.42 3.22(3) 150 yes
N9 H9C O14A 1_455 0.89 2.49 3.148(18) 132 yes
N10 H10A O18B 2_656 0.89 2.49 3.00(3) 117 yes
N10 H10A O20A 2_656 0.89 2.31 2.857(18) 120 yes
N10 H10A O20B 2_656 0.89 2.30 3.04(3) 141 yes
N10 H10C O18A 1_455 0.89 2.36 3.155(15) 149 yes
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N7 H7B O10B . 0.89 2.22 3.09(2) 165 yes
N7 H7C O25 2_566 0.89 2.59 3.151(14) 122 yes
N7 H7C O26 2_566 0.89 2.15 3.042(14) 177 yes