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#$Date: 2025-08-23 00:36:08 +0100 (Sat, 23 Aug 2025) $
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data_8000007
loop_
_publ_author_name
'Ho-Chol Chang'
'Nao Nishida'
'Susumu Kitagawa'
_publ_section_title
;
 Formation of a Ligand-based Mixed-valence Cluster Triggered by
 Dehydration Condensation of Semiquinonates with o-Phenylenediamines
;
_journal_issue                   3
_journal_name_full               'Chemistry Letters'
_journal_page_first              402
_journal_paper_doi               10.1246/cl.2005.402
_journal_volume                  34
_journal_year                    2005
_chemical_formula_sum            'C114 H88 Co5 O19'
_chemical_formula_weight         2056.60
_space_group_IT_number           61
_symmetry_cell_setting           orthorhombic
_symmetry_Int_Tables_number      61
_symmetry_space_group_name_Hall  '-P 2ac 2ab'
_symmetry_space_group_name_H-M   'P b c a'
_cell_angle_alpha                90
_cell_angle_beta                 90
_cell_angle_gamma                90
_cell_formula_units_Z            8
_cell_length_a                   23.109(1)
_cell_length_b                   26.160(1)
_cell_length_c                   36.850(1)
_cell_measurement_reflns_used    25862
_cell_measurement_temperature    223.2
_cell_measurement_theta_max      27.5
_cell_measurement_theta_min      3.0
_cell_volume                     22276(1)
_computing_cell_refinement       CRYSTALCLEAR
_computing_data_collection       CRYSTALCLEAR
_computing_data_reduction        'teXsan Ver. 1.11'
_computing_publication_material  'teXsan Ver. 1.11'
_computing_structure_refinement  'teXsan Ver. 1.10'
_computing_structure_solution    'DIRDIF94 (PATTY)'
_diffrn_detector_area_resol_mean 14.62
_diffrn_measured_fraction_theta_full 0.9624
_diffrn_measured_fraction_theta_max 0.9624
_diffrn_measurement_device_type  'Rigaku/MSC Mercury CCD'
_diffrn_measurement_method       \w
_diffrn_radiation_type           'Mo K\a'
_diffrn_radiation_wavelength     0.7107
_diffrn_reflns_av_R_equivalents  0.048
_diffrn_reflns_limit_h_max       26
_diffrn_reflns_limit_h_min       -27
_diffrn_reflns_limit_k_max       30
_diffrn_reflns_limit_k_min       -32
_diffrn_reflns_limit_l_max       45
_diffrn_reflns_limit_l_min       -42
_diffrn_reflns_number            112460
_diffrn_reflns_theta_full        27.4835
_diffrn_reflns_theta_max         27.4835
_exptl_absorpt_coefficient_mu    0.791
_exptl_absorpt_correction_T_max  0.939
_exptl_absorpt_correction_T_min  0.644
_exptl_absorpt_correction_type   multi-scan
_exptl_absorpt_process_details   '(Jacobson, 1998)'
_exptl_crystal_colour            green
_exptl_crystal_density_diffrn    1.226
_exptl_crystal_density_method    'not measured'
_exptl_crystal_description       plate
_exptl_crystal_F_000             8472
_exptl_crystal_size_max          0.700
_exptl_crystal_size_mid          0.220
_exptl_crystal_size_min          0.080
_refine_diff_density_max         1.39
_refine_diff_density_min         -0.67
_refine_ls_extinction_method     none
_refine_ls_goodness_of_fit_ref   2.080
_refine_ls_hydrogen_treatment    none
_refine_ls_number_parameters     1205
_refine_ls_number_reflns         9632
_refine_ls_R_factor_gt           0.1040
_refine_ls_shift/su_max          0.0013
_refine_ls_structure_factor_coef Fsqd
_refine_ls_weighting_details
'w = 1/[\s^2^(Fo^2^) + (0.09000(Max(Fo^2^,0) + 2Fc^2^)/3)^2^]'
_refine_ls_weighting_scheme      calc
_refine_ls_wR_factor_ref         0.2654
_reflns_number_gt                9632
_reflns_number_total             25715
_reflns_threshold_expression     F^2^>2.0\s(F^2^)
_cod_original_formula_sum        'C114 H88 Co5 O19 '
_cod_database_code               8000007
loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
x,y,z
1/2+x,1/2-y,-z
-x,1/2+y,1/2-z
1/2-x,-y,1/2+z
-x,-y,-z
1/2-x,1/2+y,z
x,1/2-y,1/2+z
1/2+x,y,1/2-z
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
_atom_site_calc_flag
_atom_site_refinement_flags
Co(1) Co 0.29320(7) 0.11912(6) 0.16945(4) 0.0388(5) Uani 1.00 d .
Co(2) Co 0.21527(7) 0.07564(6) 0.22882(5) 0.0411(5) Uani 1.00 d .
Co(3) Co 0.30569(7) 0.15615(6) 0.24890(5) 0.0404(5) Uani 1.00 d .
Co(4) Co 0.28504(7) 0.15127(6) 0.08708(5) 0.0425(5) Uani 1.00 d .
Co(5) Co 0.36293(7) 0.06284(7) 0.11120(5) 0.0446(5) Uani 1.00 d .
O(1) O 0.3318(3) 0.1774(3) 0.1992(2) 0.042(2) Uani 1.00 d .
O(2) O 0.2675(3) 0.1782(3) 0.1378(2) 0.039(2) Uani 1.00 d .
O(3) O 0.2140(3) 0.0809(3) 0.1743(2) 0.042(2) Uani 1.00 d .
O(4) O 0.2795(3) 0.0788(3) 0.1147(2) 0.046(2) Uani 1.00 d .
O(5) O 0.3021(3) 0.0820(3) 0.2239(2) 0.039(2) Uani 1.00 d .
O(6) O 0.3681(3) 0.0766(3) 0.1640(2) 0.042(2) Uani 1.00 d .
O(7) O 0.1482(3) 0.0919(3) 0.2609(2) 0.043(3) Uani 1.00 d .
O(8) O 0.2182(3) 0.1578(3) 0.2276(2) 0.036(2) Uani 1.00 d .
O(9) O 0.2624(4) 0.1213(3) 0.2916(2) 0.051(3) Uani 1.00 d .
O(10) O 0.2825(4) 0.2193(3) 0.2794(2) 0.044(2) Uani 1.00 d .
O(11) O 0.3146(4) 0.1121(3) 0.0409(2) 0.050(3) Uani 1.00 d .
O(12) O 0.3141(4) 0.2110(3) 0.0547(2) 0.048(3) Uani 1.00 d .
O(13) O 0.4232(4) 0.0644(3) 0.0727(2) 0.050(3) Uani 1.00 d .
O(14) O 0.3738(3) 0.1449(3) 0.1043(2) 0.042(2) Uani 1.00 d .
O(15) O 0.2060(4) -0.0012(3) 0.2408(2) 0.052(3) Uani 1.00 d .
O(16) O 0.3598(4) -0.0168(3) 0.1123(2) 0.052(3) Uani 1.00 d .
O(17) O 0.3869(4) 0.1439(4) 0.2735(2) 0.059(3) Uani 1.00 d .
O(18) O 0.1994(4) 0.1495(4) 0.0704(3) 0.065(3) Uani 1.00 d .
O(19) O 0.1101(8) 0.1704(6) 0.1115(5) 0.1936 Uiso 1.00 d G
C(1) C 0.3225(5) 0.2220(5) 0.1813(4) 0.044(4) Uani 1.00 d .
C(2) C 0.3511(5) 0.2687(5) 0.1941(4) 0.047(4) Uani 1.00 d .
C(3) C 0.3861(6) 0.2685(5) 0.2264(4) 0.059(5) Uani 1.00 d .
C(4) C 0.4160(6) 0.3117(6) 0.2370(4) 0.066(5) Uani 1.00 d .
C(5) C 0.4115(7) 0.3552(6) 0.2167(5) 0.068(5) Uani 1.00 d .
C(6) C 0.3786(7) 0.3574(5) 0.1860(4) 0.059(5) Uani 1.00 d .
C(7) C 0.3451(6) 0.3140(4) 0.1733(4) 0.055(4) Uani 1.00 d .
C(8) C 0.3079(5) 0.3162(5) 0.1424(4) 0.047(4) Uani 1.00 d .
C(9) C 0.2975(7) 0.3607(5) 0.1209(4) 0.059(5) Uani 1.00 d .
C(10) C 0.2626(8) 0.3602(6) 0.0926(4) 0.070(6) Uani 1.00 d .
C(11) C 0.2320(7) 0.3166(5) 0.0837(4) 0.065(5) Uani 1.00 d .
C(12) C 0.2392(6) 0.2728(5) 0.1028(4) 0.054(4) Uani 1.00 d .
C(13) C 0.2790(5) 0.2714(5) 0.1322(3) 0.046(4) Uani 1.00 d .
C(14) C 0.2912(5) 0.2235(4) 0.1506(3) 0.042(4) Uani 1.00 d .
C(15) C 0.1974(5) 0.0511(5) 0.1468(3) 0.043(4) Uani 1.00 d .
C(16) C 0.1432(5) 0.0239(4) 0.1493(4) 0.046(4) Uani 1.00 d .
C(17) C 0.1057(5) 0.0282(5) 0.1796(4) 0.049(4) Uani 1.00 d .
C(18) C 0.0542(5) 0.0024(6) 0.1818(4) 0.055(4) Uani 1.00 d .
C(19) C 0.0382(6) -0.0294(6) 0.1530(5) 0.068(5) Uani 1.00 d .
C(20) C 0.0725(6) -0.0346(5) 0.1226(4) 0.062(5) Uani 1.00 d .
C(21) C 0.1258(6) -0.0086(5) 0.1194(4) 0.051(4) Uani 1.00 d .
C(22) C 0.1620(6) -0.0117(5) 0.0871(4) 0.051(4) Uani 1.00 d .
C(23) C 0.1463(7) -0.0413(6) 0.0571(4) 0.066(5) Uani 1.00 d .
C(24) C 0.1832(8) -0.0447(6) 0.0271(4) 0.073(6) Uani 1.00 d .
C(25) C 0.2346(7) -0.0182(6) 0.0256(4) 0.066(5) Uani 1.00 d .
C(26) C 0.2495(6) 0.0123(5) 0.0544(3) 0.054(4) Uani 1.00 d .
C(27) C 0.2142(6) 0.0170(5) 0.0862(3) 0.054(4) Uani 1.00 d .
C(28) C 0.2288(5) 0.0506(5) 0.1155(3) 0.045(4) Uani 1.00 d .
C(29) C 0.3482(5) 0.0488(4) 0.2224(3) 0.041(4) Uani 1.00 d .
C(30) C 0.3602(6) 0.0164(4) 0.2541(4) 0.049(4) Uani 1.00 d .
C(31) C 0.3273(5) 0.0180(5) 0.2854(4) 0.046(4) Uani 1.00 d .
C(32) C 0.3388(6) -0.0125(6) 0.3151(4) 0.063(5) Uani 1.00 d .
C(33) C 0.3842(7) -0.0471(6) 0.3138(5) 0.067(5) Uani 1.00 d .
C(34) C 0.4180(7) -0.0502(5) 0.2832(5) 0.064(5) Uani 1.00 d .
C(35) C 0.4084(6) -0.0192(4) 0.2518(4) 0.050(4) Uani 1.00 d .
C(36) C 0.4449(6) -0.0202(5) 0.2204(4) 0.049(4) Uani 1.00 d .
C(37) C 0.4933(7) -0.0523(6) 0.2169(5) 0.070(5) Uani 1.00 d .
C(38) C 0.5286(7) -0.0517(6) 0.1883(5) 0.073(6) Uani 1.00 d .
C(39) C 0.5176(6) -0.0170(6) 0.1598(5) 0.069(5) Uani 1.00 d .
C(40) C 0.4701(6) 0.0141(5) 0.1611(4) 0.056(5) Uani 1.00 d .
C(41) C 0.4322(5) 0.0138(5) 0.1910(4) 0.045(4) Uani 1.00 d .
C(42) C 0.3824(5) 0.0460(4) 0.1922(3) 0.037(3) Uani 1.00 d .
C(43) C 0.1376(5) 0.1405(5) 0.2635(3) 0.043(4) Uani 1.00 d .
C(44) C 0.0880(5) 0.1596(5) 0.2839(3) 0.042(4) Uani 1.00 d .
C(45) C 0.0552(6) 0.1247(5) 0.3055(4) 0.054(4) Uani 1.00 d .
C(46) C 0.0089(6) 0.1435(6) 0.3259(4) 0.062(5) Uani 1.00 d .
C(47) C -0.0046(6) 0.1937(6) 0.3263(4) 0.063(5) Uani 1.00 d .
C(48) C 0.0273(6) 0.2291(5) 0.3058(4) 0.049(4) Uani 1.00 d .
C(49) C 0.0753(5) 0.2123(5) 0.2832(3) 0.043(4) Uani 1.00 d .
C(50) C 0.1073(5) 0.2470(5) 0.2608(4) 0.048(4) Uani 1.00 d .
C(51) C 0.0925(6) 0.2991(5) 0.2560(4) 0.056(4) Uani 1.00 d .
C(52) C 0.1248(6) 0.3316(5) 0.2343(4) 0.055(4) Uani 1.00 d .
C(53) C 0.1741(7) 0.3138(5) 0.2179(4) 0.057(5) Uani 1.00 d .
C(54) C 0.1918(6) 0.2636(5) 0.2221(4) 0.051(4) Uani 1.00 d .
C(55) C 0.1576(5) 0.2296(4) 0.2440(3) 0.040(4) Uani 1.00 d .
C(56) C 0.1747(5) 0.1760(4) 0.2459(3) 0.034(3) Uani 1.00 d .
C(57) C 0.2325(5) 0.1543(5) 0.3101(3) 0.043(4) Uani 1.00 d .
C(58) C 0.1945(5) 0.1403(5) 0.3394(3) 0.046(4) Uani 1.00 d .
C(59) C 0.1870(6) 0.0878(6) 0.3475(4) 0.062(5) Uani 1.00 d .
C(60) C 0.1518(7) 0.0738(6) 0.3759(4) 0.068(5) Uani 1.00 d .
C(61) C 0.1244(7) 0.1110(7) 0.3957(4) 0.078(6) Uani 1.00 d .
C(62) C 0.1285(6) 0.1620(7) 0.3873(4) 0.065(5) Uani 1.00 d .
C(63) C 0.1644(6) 0.1774(6) 0.3586(4) 0.056(5) Uani 1.00 d .
C(64) C 0.1723(6) 0.2309(6) 0.3493(4) 0.057(5) Uani 1.00 d .
C(65) C 0.1407(6) 0.2714(7) 0.3665(4) 0.064(5) Uani 1.00 d .
C(66) C 0.1487(7) 0.3215(6) 0.3569(5) 0.069(5) Uani 1.00 d .
C(67) C 0.1881(7) 0.3355(6) 0.3309(4) 0.061(5) Uani 1.00 d .
C(68) C 0.2191(6) 0.2979(5) 0.3128(4) 0.053(4) Uani 1.00 d .
C(69) C 0.2118(5) 0.2460(5) 0.3223(3) 0.044(4) Uani 1.00 d .
C(70) C 0.2436(5) 0.2079(5) 0.3025(3) 0.042(4) Uani 1.00 d .
C(71) C 0.3489(5) 0.1402(5) 0.0218(3) 0.042(4) Uani 1.00 d .
C(72) C 0.3825(6) 0.1220(5) -0.0085(3) 0.048(4) Uani 1.00 d .
C(73) C 0.3801(6) 0.0690(6) -0.0172(4) 0.055(4) Uani 1.00 d .
C(74) C 0.4114(7) 0.0506(6) -0.0464(4) 0.068(5) Uani 1.00 d .
C(75) C 0.4450(7) 0.0829(7) -0.0669(4) 0.068(5) Uani 1.00 d .
C(76) C 0.4488(6) 0.1349(7) -0.0581(4) 0.066(5) Uani 1.00 d .
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loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_description
_atom_type_scat_dispersion_real
_atom_type_scat_dispersion_imag
_atom_type_scat_source
C C 0.003 0.002
;International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.1)
;
H H 0.000 0.000
;International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Table 6.1.1.2)
;
O O 0.011 0.006
;International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.1)
;
Co Co 0.349 0.972
;International Tables for Crystallography
(1992, Vol. C, Tables 4.2.6.8 and 6.1.1.1)
;
loop_
_geom_angle_atom_site_label_1
_geom_angle_atom_site_label_2
_geom_angle_atom_site_label_3
_geom_angle
_geom_angle_publ_flag
O(1) Co(1) O(2) 82.5(3) yes
O(1) Co(1) O(3) 133.0(3) yes
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O(1) Co(3) O(5) 82.5(3) yes
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Co(1) O(1) Co(3) 98.5(3) yes
Co(1) O(1) C(1) 107.9(7) yes
Co(3) O(1) C(1) 129.3(7) yes
Co(1) O(2) Co(4) 101.9(3) yes
Co(1) O(2) C(14) 109.9(7) yes
Co(4) O(2) C(14) 122.0(7) yes
Co(1) O(3) Co(2) 96.0(3) yes
Co(1) O(3) C(15) 117.8(7) yes
Co(2) O(3) C(15) 136.2(7) yes
Co(4) O(4) Co(5) 95.6(3) yes
Co(4) O(4) C(28) 122.0(7) yes
Co(5) O(4) C(28) 135.6(7) yes
Co(1) O(5) Co(2) 91.5(3) yes
Co(1) O(5) Co(3) 89.8(3) yes
Co(1) O(5) C(29) 108.1(7) yes
Co(2) O(5) Co(3) 94.2(3) yes
Co(2) O(5) C(29) 136.1(7) yes
Co(3) O(5) C(29) 123.8(7) yes
Co(1) O(6) Co(5) 98.2(3) yes
Co(1) O(6) C(42) 116.6(7) yes
Co(5) O(6) C(42) 131.5(7) yes
Co(2) O(7) C(43) 113.5(7) yes
Co(2) O(8) Co(3) 90.1(3) yes
Co(2) O(8) C(56) 109.3(6) yes
Co(3) O(8) C(56) 122.9(7) yes
Co(3) O(9) C(57) 111.2(7) yes
Co(3) O(10) C(70) 111.1(8) yes
Co(4) O(11) C(71) 111.3(7) yes
Co(4) O(12) C(84) 111.5(8) yes
Co(5) O(13) C(85) 113.5(8) yes
Co(4) O(14) Co(5) 90.0(3) yes
Co(4) O(14) C(98) 124.7(7) yes
Co(5) O(14) C(98) 108.2(7) yes
Co(2) O(15) C(99) 125.7(8) yes
Co(2) O(15) C(102) 125.5(8) yes
C(99) O(15) C(102) 107.8(10) yes
Co(5) O(16) C(103) 126.2(8) yes
Co(5) O(16) C(106) 126.4(8) yes
C(103) O(16) C(106) 107(1) yes
Co(3) O(17) C(107) 121.7(8) yes
Co(3) O(17) C(110) 125.6(8) yes
C(107) O(17) C(110) 112(1) yes
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O(1) C(1) C(14) 121(1) yes
C(2) C(1) C(14) 119(1) yes
C(1) C(2) C(3) 121(1) yes
C(1) C(2) C(7) 118(1) yes
C(3) C(2) C(7) 120(1) yes
C(2) C(3) C(4) 120(1) yes
C(3) C(4) C(5) 119(1) yes
C(4) C(5) C(6) 122(1) yes
C(5) C(6) C(7) 122(1) yes
C(2) C(7) C(6) 115(1) yes
C(2) C(7) C(8) 121(1) yes
C(6) C(7) C(8) 123(1) yes
C(7) C(8) C(9) 125(1) yes
C(7) C(8) C(13) 117(1) yes
C(9) C(8) C(13) 116(1) yes
C(8) C(9) C(10) 122(1) yes
C(9) C(10) C(11) 120(1) yes
C(10) C(11) C(12) 120(1) yes
C(11) C(12) C(13) 119(1) yes
C(8) C(13) C(12) 119(1) yes
C(8) C(13) C(14) 120(1) yes
C(12) C(13) C(14) 120(1) yes
O(2) C(14) C(1) 118(1) yes
O(2) C(14) C(13) 120(1) yes
C(1) C(14) C(13) 121(1) yes
O(3) C(15) C(16) 119(1) yes
O(3) C(15) C(28) 119(1) yes
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C(15) C(16) C(17) 122(1) yes
C(15) C(16) C(21) 118(1) yes
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C(16) C(17) C(18) 122(1) yes
C(17) C(18) C(19) 118(1) yes
C(18) C(19) C(20) 121(1) yes
C(19) C(20) C(21) 121(1) yes
C(16) C(21) C(20) 117(1) yes
C(16) C(21) C(22) 119(1) yes
C(20) C(21) C(22) 122(1) yes
C(21) C(22) C(23) 121(1) yes
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C(23) C(24) C(25) 121(1) yes
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C(22) C(27) C(26) 117(1) yes
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O(4) C(28) C(15) 117(1) yes
O(4) C(28) C(27) 120(1) yes
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O(8) C(56) C(43) 117.8(10) yes
O(8) C(56) C(55) 122.5(10) yes
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C(92) C(97) C(98) 119(1) yes
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O(19) C(111) C(112) 108(1) yes
C(111) C(112) C(113) 107(1) yes
C(112) C(113) C(114) 108(1) yes
O(19) C(114) C(113) 107(1) yes
loop_
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_geom_bond_publ_flag
Co(1) O(1) 2.079(8) yes
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C(51) C(52) 1.38(2) yes
C(52) C(53) 1.37(2) yes
C(53) C(54) 1.39(2) yes
C(54) C(55) 1.44(2) yes
C(55) C(56) 1.46(2) yes
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1 PubChem 139205812